“十三五”是我國到2020年進入創(chuàng)新型國家行列的決勝階段。“十三五”科技創(chuàng)新的十二項主要指標具有繼承性、延續(xù)性、銜接性、階段性。其中尤為重要的兩項指標是：到2020年，科技進步貢獻率要從2015年的55.3％提升至60％；研發(fā)經(jīng)費與國內(nèi)生產(chǎn)總值的比例從2015年的2.1％提升至2.5％。“十三五”時期，科技創(chuàng)新重點主要從六個方面加強系統(tǒng)部署和謀劃。
1．構(gòu)筑國家先發(fā)優(yōu)勢方面
實施關(guān)系全局和長遠的重大科技項目，加快實施重大專項，啟動“科技創(chuàng)新2030重大項目”，在重要戰(zhàn)略方向率先突破；構(gòu)建具有國際競爭力的現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系，加速引領(lǐng)產(chǎn)業(yè)變革；完善支撐可持續(xù)和包容性發(fā)展的技術(shù)體系，突破資源環(huán)境、健康，公共安全等瓶頸制約，形成系統(tǒng)性技術(shù)解決方案；發(fā)展保障國家安全和戰(zhàn)略利益的技術(shù)體系，加強深海、深地、深空、深藍等領(lǐng)域戰(zhàn)略高技術(shù)部署。
2．圍繞增強原始創(chuàng)新能力
加大對好奇心驅(qū)動基礎(chǔ)研究的支持力度，引導(dǎo)科學(xué)家將學(xué)術(shù)興趣與國家目標相結(jié)合，作出更多原創(chuàng)發(fā)現(xiàn)。切實加大對非共識、變革性創(chuàng)新研究的支持力度。培育造就一批世界水平的科學(xué)家、科技領(lǐng)軍人才、高技能人才和高水平創(chuàng)新團隊，支持青年科技人才脫穎而出，壯大創(chuàng)新型企業(yè)家隊伍。在重大創(chuàng)新領(lǐng)域組建一批國家實驗室，加強國家各類科研基地和平臺統(tǒng)籌布局。
3．拓展創(chuàng)新發(fā)展空間方面
支持北京、上海建設(shè)具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心，構(gòu)筑全球開放創(chuàng)新高地；加快推進創(chuàng)新型省份和創(chuàng)新型城市建設(shè)，打造若干輻射帶動能力強的區(qū)域創(chuàng)新中心；推進國家自主創(chuàng)新示范區(qū)和高新區(qū)建設(shè)，進一步發(fā)揮國家自創(chuàng)區(qū)和高新區(qū)“領(lǐng)頭雁”作用，引領(lǐng)帶動區(qū)域創(chuàng)新發(fā)展水平整體躍升；深化國際科技合作，用好全球創(chuàng)新資源。
4．推動“雙創(chuàng)”有效服務(wù)實體經(jīng)濟方面

建設(shè)創(chuàng)業(yè)創(chuàng)新公共服務(wù)平臺，發(fā)展專業(yè)化眾創(chuàng)空間，支持眾創(chuàng)眾包眾籌眾扶，打造“互幫互助”“用戶參與”的開放式創(chuàng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)；要加強信息資源整合共享，向企業(yè)開放專利信息、科技資源和科研基地；大力發(fā)展科技服務(wù)業(yè)，提升面向創(chuàng)新全鏈條的服務(wù)能力。要鼓勵擁有豐富經(jīng)驗和創(chuàng)業(yè)資源的企業(yè)家、天使投資人和專家學(xué)者擔任創(chuàng)業(yè)導(dǎo)師，鼓勵高校開發(fā)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)交流課程；設(shè)立新興產(chǎn)業(yè)基金、中小企業(yè)基金和科技成果轉(zhuǎn)化引導(dǎo)基金，完善天使投資、創(chuàng)業(yè)投資流轉(zhuǎn)退出機制會資金投入創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)。
5．構(gòu)建激勵創(chuàng)新的體制機制方面
實行以增加知識價值為導(dǎo)向的分配政策；構(gòu)建高效研發(fā)組織體系，深入實施高等學(xué)校創(chuàng)新能力提升計劃，加快科研院所分類改革，建設(shè)一批有特色高水平科研院所；實施國家技術(shù)創(chuàng)新工程，強化企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新主體地位和主導(dǎo)作用；加快政府職能從研發(fā)管理向創(chuàng)新服務(wù)轉(zhuǎn)變，政府工作重心轉(zhuǎn)到戰(zhàn)略規(guī)劃、政策標準制定、評價評估、體制改革、法治保障等方面，做好營造環(huán)境、引導(dǎo)方向、提供服務(wù)等基礎(chǔ)性、公共性工作；要建立完善國家科技創(chuàng)新決策咨詢機制。
6．加強科學(xué)普及和創(chuàng)新文化建設(shè)方面
深入實施全民科學(xué)素質(zhì)行動計劃，全面提升公民科學(xué)素質(zhì)，加強國家科普能力建設(shè)，營造激勵創(chuàng)新的社會文化氛圍。萬鋼強調(diào)，創(chuàng)新驅(qū)動的實質(zhì)是人才驅(qū)動，沒有全民科學(xué)素質(zhì)普遍提高，就難以建立起宏大的高素質(zhì)創(chuàng)新大軍。